食品凍干機的冷凍干燥過程實際上是水的物態變化及其轉移的過程。在凍干過程有二個放熱過程和二個吸收過程，即液體生物制品放出熱量凝固成固體生物制品為放熱過程：固體生物制品在真空下吸收熱量升華成水蒸汽為吸熱過程;水蒸汽在冷凝器中放出熱量凝華成冰霜為放熱過程以及凍干結束后冰霜在冷凝器中吸收熱量熔化成水為吸熱過程。凍干食品凍干機若預凍沒有凍好，或著凍結不實，在進入階段升華干燥時，物料可能會出現“沸騰”現象，或凍干后制品表面凹凸不平，影響外觀；如果冷的過低，則會浪費了時間和能源。
水產品及肉類：貝柱、雞肉、鴨肉、蝦仁、魚、生蠔、海參、牛肉、豬肉、羊肉、兔肉等；
調味料：蒜粉、元蔥粉、西紅柿、姜粉、胡椒粉等；
蔬菜類：食用菌菇、黃瓜、蒜片、香蔥、蘑菇、豌豆、元蔥、青刀豆、胡蘿卜丁、菠菜、蘆筍、山野菜等；
速溶飲料：咖啡、湯、豆奶、茶、牛奶等。